Premier Tour (7 août 2012) :
| Nîmes Olympique (L2) - AS Monaco FC (L2) : 1-1, 5-6 t.a.b. |
| L2 contre L2 Tours (L2) - Le Havre (L2) : 3-3, 5-4 t.a.b. Laval (L2) - Le Mans (L2) : 0-0, 5-4 t.a.b. Châteauroux (L2) - Dijon (L2) : 2-2, 2-4 t.a.b. Caen (L2) - Lens (L2) : 2-1 Angers (L2) - Nantes (L2) : 2-1 a.p. Istres (L2) - Clermont (L2) : 1-2 a.p. Arles-Avignon (L2) - Guingamp (L2) : 1-0 L2 contre National Amiens (N) - Auxerre (L2) : 1-2 Metz (N) - Sedan (L2) : 3-2 Niort (L2) - Boulogne-sur-Mer (N) : 0-0, 3-2 t.a.b. Vannes (N) - GFC Ajaccio (L2) : 3-3, 7-8 t.a.b. |
Deuxième Tour (28 août 2012) :
| Chamois Niortais (L2) - AS Monaco FC (L2) : 1-2 |
| L2 contre L2 Clermont (L2) - Caen (L2) : 0-1 Laval (L2) - Angers (L2) : 0-2 Auxerre (L2) - Dijon (L2) : 2-1 GFC Ajaccio (L2) - Arles-Avignon (L2) : 1-2 L2 contre National Metz (N) - Tours (L2) : 1-0 |
16e de finale (25 et 26 septembre 2012) :
| AS Monaco FC (L2) - Valenciennes AFC (L1) : 4-2 a.p. |
| L1 contre L1 Rennes (L1) - Nancy (L1) : 3-2 Sochaux (L1) - Evian-Thonon-Gaillard (L1) : 3-2 a.p. Reims (L1) - Troyes (L1) : 1-2 Brest (L1) - Nice (L1) : 2-4 Lorient (L1) - Saint-Etienne (L1) : 1-1, 0-3 t.a.b. L1 contre L2 Caen (L2) - Toulouse (L1) : 0-1 Arles-Avignon (L2) - AC Ajaccio (L1) : 2-1 L1 contre National Bastia (L1) - Metz (N) : 3-0 L2 contre L2 Auxerre (L2) - Angers (L2) : 2-0 |
Montpellier, Paris S.G., Lille, Lyon, Bordeaux et Marseille (tous L1)
sont exemptés des 16èmes de finale en raison de leurs qualifications en coupes d'Europe.
8e de finale (30 et 31 octobre 2012) :
| AS Monaco FC (L2) - ES Troyes AC (L1) : 1-2 |
| L1 contre L1 Montpellier (L1) - Bordeaux (L1) : 1-0 Paris S.G. (L1) - Marseille (L1) : 2-0 Lille (L1) - Toulouse (L1) : 1-0, a.p. Nice (L1) - Lyon (L1) : 3-1 Sochaux (L1) - Saint-Etienne (L1) : 0-3 L1 contre L2 Bastia (L1) - Auxerre (L2) : 1-0 Rennes (L1) - Arles-Avignon (L2) : 1-0 |
| L1 contre L1 Montpellier (L1) - Nice (L1) : 3-2 Saint-Etienne (L1) - Paris S.G. (L1) : 0-0, 5-3 t.a.b. Bastia (L1) - Lille (L1) : 0-3 Rennes (L1) - Troyes (L1) : 2-1 |
| L1 contre L1 Saint-Etienne (L1) - Lille (L1) : 0-0, 7-6 t.a.b. Rennes (L1) - Montpellier (L1) : 2-0 |
| L1 contre L1 Saint-Etienne (L1) - Rennes (L1) : 1-0 |
Vainqueur Coupe de la Ligue 2013 : ASSOCIATION SPORTIVE DE SAINT-ETIENNE
vs 
